De afdeling Algemene Zaken is verantwoordelijk voor het personeelsbeleid en -beheer en het humanresourcesmanagement in de centrale administratieve diensten. De afdeling staat ook in voor de klachtencoördinatie en emancipatiezaken.
Ze staat verder in voor het algemeen logistiek beheer en de centrale aankopen van de administratieve diensten en is bevoegd voor de juridische aangelegenheden ten gerieve van de centrale administratie, de scholen en de scholengroepen.
Tot de afdeling behoort ook de onderzoekscel, die ter beschikking staat van de scholengroepen en onderzoeken kan uitvoeren in alle scholen van het GO!